Za nejstarší historií dnešního zámku Hluboká se musíme vrátit v čase do druhé poloviny 13. století. Tehdy zde byla postavena raně gotická tvrz. Na jejím místě byl koncem 15. století postaven gotický hrad, který vybudoval Vilém z Pernštejna. Jeho majitelem se později stal král Ferdinand I. Habsburský a ten jej prodal roku 1562. Hluboká se stala majetkem pánů z Jindřichova Hradce, kteří hrad přestavili na renesanční zámek. O sto let později zakoupil panství Jan Adolf I. z rodu Schwarzenberků, který založil jihočeskou větev rodu, jenž zde sídlila téměř tři stovky let.
Počátkem 18. století byl za knížete Adama Františka zámek přestavěn v barokním slohu podle plánů stavitele P. I. Bayera a jeho následovníka A. E. Martinelliho.
Ve třicátých letech 19. století nechal kníže Jan Adolf II. tehdejší zámek celý zbourat a na jeho místě vybudoval zámek nový a to v romantickém stylu. Projekt připravil architekt Franz Beer a ten také od roku 1840 celých dvacet let vedl stavební práce. Nové budovy byly postaveny ve stylu tudorovské gotiky podle anglického královského zámku Windsor. Práce byly dokončeny až v roce 1871 pod vedením D. Deworetzkého. Zámek je obklopen anglickým parkem se sochařskou výzdobou.
Dnes patří zámek Hluboká k turisticky nejatraktivnějším památkám v Česku.