Městys Sepekov patří mezi nejstarší obce píseckého okresu, místo i okolí bylo osídleno již v době bronzové a železné. O Sepekově se pak dozvídáme poprvé v písemné zmínce z roku 1243.
Největší zdejší památkou je kostel zasvěcený Panně Marii. Je obklopen ambity s kaplemi v rozích a byl vysvěcen v roce 1733. Věhlas kostela se rozšířil zveřejněním několika zázračných uzdravení.